Часть 1 — вводная. Есть цивилизация Инженеров. Хобби — колонизация планет путем создания на них жизни, возможно, похожей на самих Инженеров. Они создают жизнь не только на Земле (не очень похоже получилось), но и на планете, где происходит действие Завета. Обитатели здесь более похожи на творцов, но это — не основная цивилизация, всего лишь побочная ветвь, один город с ограниченным числом жителей. Судя по строениям и прикиду обитателей, колония находится на начальном, дофеодальном уровне развития, примерно как майя и ацтеки. Неразвитые обитатели колонии считают Инженеров божествами и поклоняются им и месту причала корабля. Технологий нет, защиты нет, обитателям города в голову не приходит, что на божественном корабле может прилететь кто-то еще. Инженеры присматривают за всеми колониями, иногда посещая их, и не прекращают экспериментов по созданию совершенной жизни. Основная база для экспериментов — планета из Прометея LV-223.
Часть 2 — Прометей. На Земле корпорация «Вейланд Индастриз» стремится к улучшению человеческой природы через неуязвимость и вечную жизнь. Все это можно получить у цивилизации Инженеров, их-то корпорация и ищет. В процессе поисков корпорация находит LV-223 (планету из Прометея) и посылает туда исследовательскую группу, заранее зная, что там обнаружится испытательский полигон Инженеров и надеясь застать их там. Основная функция в группе принадлежит андроиду Дэвиду. Люди — всего лишь необходимая ширма для отвлечения внимания общественности. Старик Питер Вейланд, номинальный руководитель корпорации, со своей тягой к вечной жизни — тоже ни при чем. Его отправили истинные руководители корпорации из соображений «чтобы под ногами не путался», «пусть старое дитятко потешится», «все равно ему помирать», «уберем старикашку из руководства». По прибытии на LV-223 все идет по заранее спланированному сценарию: все лишние устранены, Дэвид получает генетический материал, который должен дальше использовать для создания новой расы. Из незапланированного — выжившая Шоу, но она особо не мешает, более того, даже оказывается в определенный момент полезной, починив Дэвида. Дэвид с генетическим материалом оправляется на планету Инженеров, восстановив стартовую точку на корабле пришельцев. Однако вот здесь корпорация просчиталась, приняв за основную планету ту самую неразвитую колонию из части 1. Прилетев на место назначения, Дэвид очищает колонию, готовя место для приема земного генетического материала (см. Завет), однако быстро понимает, что Инженеров тут нет, и когда они появятся и появятся ли вообще — фиг его знает, корабль не содержит информации по другим маршрутам, и он застрял на этой убогой планете неизвестно на сколько. Он посылает сигнал корпорации о частичном успехе миссии (генетический материал он все-таки добыл) и начинает ждать, от скуки занимаясь прикладной евгеникой.
Часть 3 — Завет. Корпорация Вейланд получает сигнал Дэвида и посылает к нему корабль с колонистами. Дэвид их ждет, разумеется, не для помощи в колонизации, а для создания совершенных существ из человеческого материала (2000 колонистов+1000 эмбрионов). Цель корабля — НЕ Оригае-6, туда он не должен был долететь при любом раскладе, скорее всего, никакой Оригае-6 вообще не существует, это ширма для общественности. Истинный пункт назначения скрыт от всех, кроме Уолтера, поэтому нет никаких исследовательских данных о загадочной планете. Поэтому данные о сканировании планеты настолько чистые и успокаивающие. Поэтому экипаж подбирается случайным образом. Это — НЕ профессионалы, не астронавты, просто перевозчики и ремонтники, совершенно не готовые к тому, что их ждет. По сути, та же ширма, что и в Прометее. Подозреваю, что специально подбирали людей максимально не готовых к прогнозируемым корпорацией ситуациям и не способных себя в них правильно вести (такое легко выявить простейшими тестами). Основная функция в экспедиции принадлежит Уолтеру, запрограммированному корпорацией. Когда корабль приближается к нужной точке (планете колонистов), происходит некая авария. О ее причине (поток нейтрино) мы узнаем от Уолтера и Матери (компьютер корпорации). Непрофессиональный экипаж не догадывается, что нейтрино не может повредить корабль, и верит на слово. Фактически, авария могла быть любой, главное — затормозить корабль в нужной точке, чтобы принять сигнал. Капитан, специально подобранный человек с комплексом неполноценности и непомерной тягой к власти, принимает решение к посадке из соображений «чтобы все было, как я решил», с одной стороны, и «подмазаться к экипажу», с другой. Дальше все идет как по маслу. Дэвид, за время пребывания на планете осознавший, что это всего лишь затхлая колония, запланировано обменивается с Уолтером сознанием или программой (что там у андроидов отвечает за личность?) и, получив в распоряжение рабочий корабль, продолжает путь в поиске Инженеров с генетическим материалом людей и чужих.